Арцахская археологическая экспедиция Института археологии и этнографии НАН РА была создана в 2004 г. Ее основной целью было проведение археологических исследований на территории Республики Арцах в рамках сотрудничества Правительства Республики Арцах и Национальной академии наук Республики Армения. С 2004 г. экспедиция проводила раскопки в Шуши и его окрестностях, в монастырях Хандаберд, Дадиванк, Сурб Степанос в Вачаре, Амарас, а также в Бердашене, Мартакерте и т. д. Результаты раскопок были опубликованы в арцахских, армянских и зарубежных научных периодических изданиях (см. раздел «Публикации»).
В 2005 г. члены экспедиции выявили археологические следы города Тигранакерт, основанного в Арцахе армянским царем Тиграном II Великим (95-55 гг. до н. э.), и с 2006 по 2020 г. на его территории были проведены масштабные раскопки.
Исследование Тигранакерта было инициировано и профинансировано Союзом общественных организаций «Еркир» по репатриации и освоению. С 2008 г. раскопки финансировало правительство Республики Арцах.
Работой экспедиции руководил старший научный сотрудник Института археологии и этнографии НАН РА, заведующий кафедрой культурологии Ереванского государственного университета, доктор исторических наук, профессор Гамлет Л. Петросян.
Постоянными членами экспедиции были доктор архитектуры, профессор Люба Киракосян (Ереванский государственный университет архитектуры и строительства), кандидат исторических наук, доцент Вардгес Сафарян (Арцахский государственный университет), кандидаты исторических наук Татьяна Варданесова (Ереванский государственный университет), Инесса Карапетян, Армине Габриелян, Нжде Еранян, Рубен Овсепян, аспирант Амазасп Абрамян (Институт археологии и этнографии НАН РА). В работах экспедиции принимали также участие доктор исторических наук Ашот Пилипосян, кандидаты исторических наук Жорес Хачатрян, Агавни Жамкочян, Нора Енгибарян, Роман Овсепян, Асмик Маргарян (Институт археологии и этнографии НАН РА), Рубен Варданян (Музей истории Армении), Айк Акопян (Ереванский государственный университет), студенты Ереванского государственного университета и Арцахского государственного университета. Непродолжительное время участниками экспедиции были также профессор истории Рима в Университете Сорбонны Джусто Трайна, археологи Сара Чампи и Франческа Келли из Флорентийского университета, а также антрополог Пол Бэйли.